植物界中，大部分都擁有復雜的根系，長短不一、縱橫交錯。很多時候，研究人員會通過測量根系來分析作物的生長的情況。過去，工作人員會用尺子、放大鏡等工具進行估測并手動記錄數據。而如今隨著技術的進步， 人們開始借助根系圖像分析系統進行測量。該儀器能快速測量出根系的長度、直徑、面積、體積、根尖記數等數據，運用的就是圖形掃描原理，通過系統提供的高分辨率彩色圖像或黑白圖像，從中自動計算出交叉重疊部分的根系長度，解決了傳統測量的不便。

    傳統的根系研究采用的是挖掘法、土鉆法、土柱法、容器法、剖面法等，這些方法有一個共同的特點，那就是破壞性大、工作量大，比如說挖掘法，該方法首先需要通過整體挖掘和雙向切片的方式挖掘根系，然后再對根系進行整體或部分的研究，其優點是簡單、易操作，缺點是工作量大，不能對根系進行連續觀察。土鉆法利用人或機械的力量驅動根鉆，從土壤中取出等體積含根的土柱，雖然取樣迅速，適用于大樣本試驗，并且對處理內其他植株的影響較小，但是缺點是對非均勻分布的根系研究時，由于取樣點的誤差會給整個試驗結果帶來較大的誤差。這些方法在進行后續根系分析的時候，都需要通過人工進行測算，非常不方便。但是如果使用根系圖像分析系統的話，就可以摒棄人工測量的弊端，避免人工誤差，而且采用圖像拍攝結合分析軟件進行處理，在很短時間內就能獲取想要的數據。
    總的來說，應用了根系圖像分析系統以后，大大克服了人工測量費時費力的缺點，為開展植物根系的深入研究提供了便利，另外這些測量數據也為及時掌握作物長勢，為開展育種工作提供了科學支撐。