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文獻(xiàn)題目:A male-pheromone-elevated transcription factor ZNF362.1 in female schistosomes determines sexual maturation
發(fā)表期刊:Science Advances
影響因子:12.5
發(fā)表時間:2026年3月6日
發(fā)表單位:復(fù)旦大學(xué)
藍(lán)景科信提供:DAP-seq技術(shù)服務(wù)
主要研究內(nèi)容
血吸蟲病由血吸蟲感染所致,全球受影響人群超2億,雌性血吸蟲的產(chǎn)卵行為是該病傳播和病理損傷發(fā)生的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。已知雌性血吸蟲的卵巢與卵黃腺成熟依賴雄性分泌的信息素β-丙氨酰-色胺(BATT),但BATT觸發(fā)雌性生殖成熟的下游分子調(diào)控通路此前尚未明確。
本研究解析了BATT調(diào)控雌性生殖成熟的分子機(jī)制,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子znf362的長異構(gòu)體znf362.1是BATT誘導(dǎo)雌性卵巢和卵黃腺成熟的下游關(guān)鍵調(diào)控因子,該因子在BATT處理后,于卵巢卵母細(xì)胞和卵黃腺S1細(xì)胞中特異性上調(diào),且僅調(diào)控生殖干細(xì)胞的分化過程,不影響其增殖。
研究團(tuán)隊通過DAP-seq技術(shù)繪制了ZNF362.1的全基因組結(jié)合圖譜,發(fā)現(xiàn)其DNA結(jié)合域優(yōu)先結(jié)合基因組的內(nèi)含子(40.56%)和遠(yuǎn)端基因間區(qū)(37.80%),僅有9.65%的結(jié)合峰位于啟動子區(qū)域;同時鑒定出六核苷酸“AAAAAA”為其富集度最高的特異性結(jié)合基序。接著通過DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析,篩選出其直接靶基因為Smp_349410。經(jīng)EMSA、Dual-LUC等進(jìn)一步驗證,ZNF362.1可通過結(jié)合Smp_349410的啟動子直接激活其轉(zhuǎn)錄,而該基因編碼的SmCPEB1通過差異化機(jī)制調(diào)控生殖器官成熟:在卵巢中,通過調(diào)控cyclin B1 mRNA的多聚腺苷酸化促進(jìn)卵母細(xì)胞減數(shù)分裂;在卵黃腺中,則通過不依賴cyclin B1的通路驅(qū)動S1細(xì)胞分化。
本研究由此系統(tǒng)闡明了“BATT-ZNF362.1-cpeb1”信號軸調(diào)控雌蟲性成熟的分子機(jī)制,并揭示了CPEB1在卵巢與卵黃腺中的差異化調(diào)控路徑。這一發(fā)現(xiàn)為理解血吸蟲的生殖調(diào)控機(jī)制提供了全新視角,也為研發(fā)阻斷蟲卵傳播的血吸蟲病干預(yù)策略提供了重要的理論支撐與潛在分子靶點。

圖1. BATT誘導(dǎo)的znf362調(diào)控未交配雌性血吸蟲的性成熟過程。(A)RNA-seq分析顯示,未交配雌蟲中有9個基因在交配后第3天受雄性信息素誘導(dǎo)表達(dá)上調(diào)。[B]與[A]比較用于鑒定與可產(chǎn)生BATT的對照雄蟲配對后,未交配雌蟲中表達(dá)上調(diào)的基因;與之相對,[D]與[A]比較則揭示了與BATT缺陷型雄蟲(gli1敲低雄蟲,喪失BATT合成能力)配對后,未交配雌蟲中上調(diào)的基因。n=3。(B)光學(xué)顯微鏡觀察未交配雌蟲在體外經(jīng)對照組或Smp_169260-RNAi處理10天后的形態(tài)學(xué)特征及產(chǎn)卵情況。左圖:dsRNA處理流程示意圖;中圖:蟲體整體形態(tài)(標(biāo)尺,1 mm);右圖:蟲卵形態(tài)(標(biāo)尺,200 μm)。n=3。(C)RNAi處理10天后未交配雌蟲中Smp_169260敲除的qPCR檢測結(jié)果。n=3。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)表示,****P<0.0001。(D)經(jīng)對照或Smp_169260-RNAi處理10天后,未交配雌蟲卵黃腺和卵巢Fast Blue BB及DAPI染色結(jié)果。成熟卵黃腺經(jīng)Fast Blue BB染色呈紅棕色(左圖)。在卵巢中(右圖),未成熟卵母細(xì)胞(IO)表現(xiàn)為染色質(zhì)致密、DAPI強熒光區(qū)域,而成熟卵母細(xì)胞(MO)染色較淺且細(xì)胞體積更大。n=3。標(biāo)尺,100 μm。(E)經(jīng)對照組或Smp_169260dsRNA處理7天后,卵巢及卵黃腺中增殖細(xì)胞的EdU標(biāo)記情況。EdU陽性細(xì)胞呈品紅色,細(xì)胞核用DAPI復(fù)染呈藍(lán)色。卵巢區(qū)域用黃色虛線標(biāo)注。n=3。標(biāo)尺,100 μm。(C) 采用獨立樣本Student’st檢驗。

圖2. 最長轉(zhuǎn)錄本亞型znf362.1對未交配雌性血吸蟲的生殖發(fā)育至關(guān)重要。(A)光學(xué)顯微鏡觀察經(jīng)對照組或znf362.1 dsRNA體外處理10天后未交配雌蟲的形態(tài)學(xué)特征及產(chǎn)卵情況。n=3。比例尺:蟲體整體形態(tài)1 mm;蟲卵形態(tài)200 μm。(B)RNAi處理10天后znf362.1敲除的qPCR檢測結(jié)果n=3。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。***P<0.001。(C)經(jīng)對照組與znf362.1-RNAi處理10天后,未交配雌蟲卵黃腺和卵巢的Fast Blue BB與DAPI染色結(jié)果。卵黃腺Fast Blue BB染色(左圖);右側(cè)為卵巢DAPI染色(右圖)。n=3。比例尺100 μm。(D)經(jīng)對照組與znf362.1 dsRNA處理7天后,卵巢和卵黃腺中增殖細(xì)胞的EdU標(biāo)記情況。EdU陽性細(xì)胞呈品紅色,細(xì)胞核經(jīng)DAPI復(fù)染呈藍(lán)色。卵巢區(qū)域用黃色虛線標(biāo)注。n=3。比例尺100 μm。(E)BATT誘導(dǎo)后D0至D6期間znf362.1轉(zhuǎn)錄和蛋白水平定量分析。黑色和紅色虛線代表轉(zhuǎn)錄水平,藍(lán)色實線代表蛋白豐度。n=3~4。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。(F)雌蟲6天RNAi處理實驗設(shè)計示意圖。(G)對照組與RNAi處理組D0至D6期間znf362.1轉(zhuǎn)錄水平qPCR定量結(jié)果(*P=0.03)。n=3。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。(H)通過基于DIA的定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析測定的對照組與znf362.1-RNAi組在D6時間點的ZNF362.1蛋白豐度(****P<0.0001)。n=4。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。(B)、(E)、(G)和(H)均采用非配對Student’s t檢驗。

圖3. znf362.1基因表達(dá)譜及其響應(yīng)BATT刺激的單細(xì)胞動態(tài)變化。(A) WISH顯示未交配雌蟲、在A169培養(yǎng)基中經(jīng)BATT誘導(dǎo)6天的未交配雌蟲及成蟲雌蟲中znf362.1的表達(dá)情況。紫色染色標(biāo)記mRNA定位。比例尺100 μm。圖像具有代表性,n>12條蟲體,來自3次生物學(xué)重復(fù)。(B)FISH顯示未交配雌蟲卵巢與卵黃腺、成蟲雌蟲卵巢中znf362.1的表達(dá)情況。比例尺50 μm。圖像具有代表性,n>12條蟲體,來自3次生物學(xué)重復(fù)。(C)基于已鑒定的細(xì)胞類型標(biāo)記基因?qū)ξ唇慌浯葡xscRNA-seq數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析的UMAP圖。(D)對照組與BATT處理組中znf362.1表達(dá)的單細(xì)胞分辨率分析。左圖:UMAP圖展示znf362.1的相對表達(dá)水平,紅色表示表達(dá)量更高;右圖:第2天對照組與BATT處理組間不同細(xì)胞類型中znf362.1表達(dá)量的定量比較。n=3。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示(*P.adj<0.05)。

圖4. Smp_349410作為ZNF362.1的潛在下游靶標(biāo)參與雌蟲性成熟過程。(A)基于DAP-seq結(jié)果預(yù)測的ZNF362.1結(jié)合概率最高的DNA結(jié)合基序。(B)韋恩圖展示三組基因的交集:BATT處理8天后表達(dá)上調(diào)的基因、znf362.1 RNAi處理6天后表達(dá)下調(diào)的基因,以及經(jīng)DAP-seq鑒定的、啟動子區(qū)域可被ZNF362.1 DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DBD)結(jié)合的基因。(C)經(jīng)對照組或Smp_349410 dsRNA處理21天(自第7天開始BATT誘導(dǎo))后,光學(xué)顯微鏡觀察未交配雌蟲的形態(tài)學(xué)特征及產(chǎn)卵情況。n=3。比例尺:蟲體整體形態(tài)1 mm;蟲卵形態(tài)200 μm。(D)RNAi處理21天(自第7天開始BATT誘導(dǎo))后未交配雌蟲中Smp_349410敲低的qPCR檢測結(jié)果。n=3。數(shù)據(jù)以均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。****P<0.0001。(E)經(jīng)對照組與Smp_349410-RNAi處理21天(自第7天開始BATT誘導(dǎo))后未交配雌蟲卵黃腺和卵巢的Fast Blue BB與DAPI染色結(jié)果。卵黃腺Fast Blue BB染色(左圖);卵巢DAPI染色(右圖)。n=3。比例尺100 μm。(F)經(jīng)對照組或Smp_349410 dsRNA處理7天后,卵巢和卵黃腺中增殖細(xì)胞的EdU標(biāo)記情況。EdU陽性細(xì)胞呈品紅色,細(xì)胞核經(jīng)DAPI復(fù)染呈藍(lán)色。卵巢區(qū)域用黃色虛線標(biāo)注。n=3。比例尺100 μm。(D)采用非配對Student’s t檢驗。

圖5. Smp_349410是血吸蟲ZNF362.1的直接轉(zhuǎn)錄靶基因。(A)qPCR定量檢測對照組與BATT誘導(dǎo)條件下,未交配雌蟲D0~D6 Smp_349410的轉(zhuǎn)錄水平。n=3。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。**P<0.01。(B)BATT誘導(dǎo)條件下,qPCR定量檢測對照組與Smp_349410-RNAi組未交配雌蟲0~6天Smp_349410的轉(zhuǎn)錄水平。n=3。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。**P<0.01。(C)IGV展示DAP-seq在Smp_349410基因位點的覆蓋度。軌跡圖展示了兩個技術(shù)重復(fù)及一個input對照樣本中,比對至曼氏血吸蟲參考基因組(版本10)的reads。y軸表示單堿基reads覆蓋度。啟動子區(qū)域以黃色方框標(biāo)注。(D)EMSA驗證ZNF362.1與Smp_349410啟動子基序的結(jié)合。泳道1:僅FAM標(biāo)記探針(無蛋白);泳道2:FAM標(biāo)記探針與ZNF362.1 DBD共孵育;泳道3:加入100倍摩爾過量的未標(biāo)記探針進(jìn)行競爭結(jié)合。(E)雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烌炞CZNF362.1 DBD對Smp_349410啟動子的轉(zhuǎn)錄激活作用。NC1(陰性對照1):空載pcDNA3.1載體+含Smp_349410啟動子的報告質(zhì)粒;NC2(陰性對照2):ZNF362.1 DBD表達(dá)質(zhì)粒+不含Smp_349410啟動子的報告質(zhì)粒;ZNF362.1 DBD:含Smp_349410啟動子的ZNF362.1 DBD-VP64-NLS表達(dá)質(zhì)粒+報告質(zhì)粒。GLI1 DBD:GLI1 DBD-VP64-NLS表達(dá)質(zhì)粒+含Smp_349410啟動子的報告基因載體。n=3。數(shù)據(jù)以均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。****P<0.0001。(A)、(B)和(E)采用非配對Student‘s t檢驗。

圖6. Smp_349410在雌性血吸蟲生殖腺中特異性表達(dá)。(A)WISH顯示Smp_349410 在未交配雌蟲、在A169中經(jīng)BATT處理6天的未交配雌蟲及成蟲雌蟲中的表達(dá)情況。紫色染色標(biāo)記mRNA定位。比例尺100 μm。代表性圖像來自3次生物學(xué)重復(fù),n>12條蟲體。(B)FISH顯示Smp_349410在未交配雌蟲卵巢及卵黃腺、成蟲雌蟲卵巢中的表達(dá)情況。比例尺50 μm。代表性圖像來自3次生物學(xué)重復(fù),n>12條蟲體。(C)對照組與BATT處理組中Smp_349410表達(dá)的單細(xì)胞分辨率分析。左圖:UMAP圖展示Smp_349410的平均表達(dá)水平,紅色表示表達(dá)量更高;右圖:D2對照組與BATT處理組間不同細(xì)胞類型中Smp_349410表達(dá)量的定量比較。n=3。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示(*P.adj<0.05)。(D)基于已鑒定的細(xì)胞類型標(biāo)記基因?qū)Τ赡甏葡x生殖系scRNA-seq數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析的UMAP圖。(E)成年雌蟲生殖系中Smp_349410表達(dá)的UMAP圖,紅色表示表達(dá)水平更高。

圖7. Cpeb1在雌性血吸蟲生殖發(fā)育過程中調(diào)控cyclin B1 mRNA多聚腺苷酸化。(A)經(jīng)對照組、ccnb1或cdk1 dsRNA處理19天后(自D7開始BATT誘導(dǎo)),雌蟲卵黃腺和卵巢的Fast Blue BB和DAPI染色結(jié)果。卵黃腺Fast Blue BB染色(左圖);卵巢DAPI染色(右圖)。n=3。比例尺:100 μm。(B)經(jīng)對照組、ccnb1或cdk1 dsRNA處理7天后,卵巢和卵黃腺中增殖細(xì)胞的EdU標(biāo)記情況。EdU陽性細(xì)胞呈品紅色;細(xì)胞核經(jīng)DAPI(藍(lán)色)復(fù)染。卵巢區(qū)域用黃色虛線標(biāo)出。n=3。比例尺:100 μm。(C)用于RNA提取的體組織、卵巢及卵黃腺解剖示意圖;方框區(qū)域為從雌蟲中切取的組織部位。(D)基于PCR分析cyclin B1 mRNA多聚腺苷酸尾(poly(A))長度的實驗示意圖。Poly(A)PCR擴(kuò)增poly(A)區(qū)域(A);基因特異性PCR靶向3'UTR區(qū)域(S)用于比對。尾長計算公式為A?S?30[S=113 bp;30為反向引物至poly(A)起始位點的距離]。(E)未交配雌蟲、BATT誘導(dǎo)對照RNAi雌蟲及BATT誘導(dǎo)cpeb1 RNAi雌蟲的體組織、卵巢和卵黃腺中cyclin B1 mRNA的poly(A)尾分析。A:poly(A)尾PCR產(chǎn)物;S:基因特異性PCR產(chǎn)物;M:100 bpDNA分子量標(biāo)準(zhǔn)。經(jīng)灰度分析后根據(jù)峰頂點(箭頭)估算相對poly(A)尾長度。n=3。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。**P<0.01,*P<0.05。(E)采用非配對Student’s t 檢驗。

圖8. ZNF362.1介導(dǎo)曼氏雌性血吸蟲響應(yīng)雄蟲來源BATT信號調(diào)控性發(fā)育的轉(zhuǎn)錄調(diào)控模式圖。在未交配雌蟲中,卵巢與卵黃腺的分化處于停滯狀態(tài),卵巢發(fā)育阻滯于生殖干細(xì)胞(GSC)子代階段,卵黃腺發(fā)育阻滯于S1細(xì)胞階段。雌雄配對后,雄蟲來源的信息素BATT誘導(dǎo)雌蟲中轉(zhuǎn)錄因子znf362.1表達(dá)上調(diào)。ZNF362.1隨后在卵巢和卵黃腺中均激活cpeb1的轉(zhuǎn)錄。在卵巢中,CPEB1水平升高可增強減數(shù)分裂關(guān)鍵調(diào)控因子cyclin B1 mRNA的多聚腺苷酸化,進(jìn)而促進(jìn)卵母細(xì)胞成熟。在卵黃腺中,CPEB1通過一條似乎不依賴cyclin B1 mRNA多聚腺苷酸化的通路調(diào)控增殖態(tài)S1細(xì)胞的分化進(jìn)程。

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