交直流微電網綜合監控系統采用三層結構方式，即分為微電網綜合監控主站層、微電網運行控制層、微電網就地控制層，各層功能如下：
1）交直流微電網綜合控制主站層（平臺層）
微網綜合控制主站系統的基礎功能是監控微電網的實時運行數據，同時，微電網綜合監控主站系統還可實現分布式發電預測、負荷預測、電能質量分析、電能統計分析、無功優化等高級應用功能。微電網綜合監控主站系統根據實時運行數據，結合分布式發電預測、負荷預測等應用分析結果，制定多約束條件下的微電網系統優化調度與能量管理策略，并將制定后的策略下發微電網運行控制器。
2）交直流微電網運行控制層
交直流微電網微電網運行控制層由交直流協調控制裝置和就地協調控制裝置、融合終端組成。微電網運行控制層功能：交直流協調控制裝置主要負責接受、翻譯并執行平臺主站下達的控制策略，完成對主交直流微電網的運行控制任務，主要功能包括：交直流微電網常規運行控制、聯絡線功率控制，交直流微電網并離網切換、分布式發電單元監控、臺區負載均衡、交直流轉供等。
3）微電網就地控制層
微電網就地控制層主要由就地協調控制裝置實現微電網控制功能的各關鍵設備組成，主要控制設備包括：分布式發電控制單元（光伏逆變器、光伏 DCDC等）、儲能變流器（PCS、DCDC）、交直流配電開關、低壓交直流柔性接口設備等。就地控制層設備通過執行交直流協調控制裝置的控制指令，完成相關操作，實現交直流微電網的運行控制功能。
